Парвозҳои ин ширкат аз рӯзи 31 марти соли равон дар масири Душанбе-Теҳрон ва Душанбе-Диҳлии нав ва баръакс оғоз ва ба тадреҷ дар дигар масирҳо аз сар гирифта мешавад.
Ин ширкат қабл аз тавофуқи тамомии паврвозҳои худ аз фурудгоҳҳои Тоҷикистон ба 13 шаҳри Русия парвоз анҷом медод. Бо таваққуфи парвозҳои ширкати ҳавопаймоии давлатии Тоҷик Эйр тамомии кормандони он ба рухсати бидуни ҳуқуқ рафта буданд. Мушкилоти ширкати Тоҷик Эйр замоне ташдид шуд, ки Эмомалӣ Раҳмон раиси ҷумҳури Тоҷикистон дар моҳи декабри соли 2018 дастури бозрасии амалкарди молии ширкатро содир кард.
Раиси ҷумҳури Тоҷикистон ба Ожонси давлатии мубориза бо фасоди молии ин кишвар дастур додааст, ки мавзӯъи харидории як ҳавопаймои Боинги 767 гаронтар аз нархи воқеъии онро аз сӯи ин ширкат ва санадсозӣ дар ин мавридро бозрасӣ кунад.
Ҳамчунин Эмомалӣ Раҳмон рушан шудани моҷарои 3 моҳ пардохт нашудани ҳуқуқи кормандони ин ширкат, таъхир дар пардохти ҳаққи истифода аз фурудгоҳи Душанбе ва қарзи он ширкат аз ширкати воҳиди сӯзишрасонӣ дар фурудгоҳҳоро хостор шудааст. Акнун бо барканории мудир ва масъулони собиқи ширкати ҳавопаймоии давлатии Тоҷик Эйр иҷозатномаи аз саргирии парвозҳои ин ширкат содир шудааст.